運行人數分為垂直流動實驗室用低溫操作臺和水平流動實驗室用低溫操作臺；超凈工作臺從運行人數上分為單工和雙工；超凈工作臺從結構上分為常規型、新型型和自循環型(僅垂直型)。

超凈工作臺和水平流動超凈工作臺，垂直工作臺由于風機在頂部，噪音較大，但風是用來垂直吹的，以保證身體健康；水平流動工作臺噪音較小，風向外因此多用于電子行業，對健康影響不大。按作業結構可分為單邊作業和雙邊作業，按用途可分為普通超凈臺和生物(醫藥)超凈臺。

按數量劃分:單個實驗室用低溫操作臺，雙人實驗室用低溫操作臺；

根據使用面的數量分類:分為單側操作和雙側操作；需要注意的是，單面和雙面只適用于垂直超凈臺，而水平超凈臺沒有單面和雙面。